El Comité Ejecutivo de la ASCIM es el equipo encargado de llevar a cabo las acciones necesarias para alcanzar los objetivos de la ASCIM. Esta conformado por las siguientes personas:
- Director Ejecutivo
- Vicedirector
- Gerente del Departamento Agropecuario
- Gerente del Departamento Intercultural, Social y Espiritual
- Gerente del Departamento de Salud
- Gerente del Departamento de Educación
Los miembros del Comité Ejecutivo son seleccionados y designados por el Consejo de Administración de la ASCIM. Se reúnen dos veces al mes para compartir información sobre las labores realizadas y tomar decisiones en cuanto a la ejecución de programas y situaciones actuales.
El Director Ejecutivo tiene la responsabilidad de coordinar todas las actividades de asesoramiento y mantener una comunicación fluido con los asociados. También el es encargado de la gestión financiera de la ASCIM y de establecer relacionamiento con organizaciones a nivel nacional e internacional, tanto públicas como privadas.
El vicedirector se encarga de transmitir información a los asociados y de reclutar, seleccionar y orientar al personal. Además, asume las funciones del Director Ejecutivo en su ausencia.
Cada departamento cuenta con equipos técnicos que se encargan de áreas específicas de trabajo. Los jefes de estos equipos técnicos se reúnen periódicamente con el gerente para la planificar y evaluar las actividades correspondientes a sus áreas.