El departamento de Educación de la ASCIM acompaña la educación indígena formal en instituciones del sector oficial y privado subvencionado, en los niveles: Inicial, Educación Escolar Básica, Nivel Medio, Mandos Medio y Terciaria. En los primeros años los escolares asisten a una escuela de su aldea donde son enseñados por docentes de habla en lengua materna del mismo grupo lingüístico. A partir del segundo ciclo se trasladan a la escuela cabecera o central. Para el Nivel Terciario están habilitadas las carreras de Formación Docente y Técnico Superior en Enfermería en el Centro Educativo Indígena Yalve Sanga, con el apoyo de la Universidad Evangélica del Paraguay.
Colabora con el Ministerio de Educación y Ciencias a través de la supervisión de las Áreas Educativas N°18-33 y N°18-37 (anteriormente Supervisión Región 3 Boquerón Zona 7 ASCIM) que supervisan a 51 instituciones educativas de comunidades indígenas en los distritos de Boquerón, Mcal. Estigarribia, Filadelfia, Loma Plata, Tte. 1° Irala Fernández y Campo Aceval, en los departamentos Boquerón y Presidente Hayes.
Objetivos específicos:
- Las comunidades socias de la ASCIM tienen jóvenes y adultos capacitados en conocimientos y habilidades con una orientación cristiana para enfrentar los desafíos de la vida.
- Hasta el 2040, los niños entre 8 y 9 años en las comunidades indígenas socias de la ASCIM saben leer, escribir y los cálculos fundamentales (adición, sustracción, multiplicación y división).
- Las comunidades socias de la ASCIM tienen docentes creativos, motivados y responsables en su labor educativa, formados y capacitados en el Centro Educativo Indígena Yalve Sanga.
- Las comunidades socias de la ASCIM tienen personas capacitadas en liderazgo, administración y gerenciamiento, y profesionales de mandos medios incluyendo la formación práctica rural y superiores.
- En las comunidades indígenas socias de la ASCIM se ofrece el preescolar para los niños de 5 años acorde a las exigencias del estado.